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基本情况
2018年在北京大学获得医学博士学位（本博八年制）长期围绕“表观遗传调控基因组稳定性”进行研究，并探索表观遗传紊乱在人类疾病进展中的作用及潜在应用价值，在Nature和Science Advances等杂志发表论文30余篇。
邮箱：lizhiming8@scu.edu.cn
工作经历
2023/07-2024/10 哥伦比亚大学 副研究员
2025/01至今 四川大学华西公共卫生学院 特聘研究员
研究方向(含承担课题)
课题组聚焦真核细胞基因组稳定性与重复序列的表观遗传调控机制，研究亲本组蛋白转运及表观遗传记忆的分子基础，探索亲本组蛋白在DNA复制中的转运机制及其在细胞命运决定中的意义。通过高通量测序、单细胞表观遗传组学和基因编辑等技术，解析基因组重复序列（如L1、ERV等）的表观遗传调控网络及其在疾病中的作用。同时，实验室还致力于开发新型表观遗传组学和基因组学技术，结合人工智能整合多组学数据，揭示基因调控网络。我们的长期研究目标是通过研究表观遗传紊乱在肿瘤进展中的作用，鉴定新型靶点，开发靶向表观遗传调控的治疗策略，为肿瘤精准医学提供新思路。
科研成果
代表性学术成果包括：
1） 首次发现抑制性组蛋白修饰H3K9me3在DNA复制时的转运机制及其生物学功能（Nature 2023，Molecular Cell 2025）。
2） 首次发现连接组蛋白H1的乙酰化和多聚合糖基化等修饰参与调控DNA损伤修复和基因组稳定性的机制（Cell Research 2018，Nucleic Acids Research 2018）；
3） 开发新型表观遗传组学技术eSPAN，并系统鉴定了Pol α和Pol ε等作为亲本组蛋白转运的分子伴侣在核小体组装和基因组稳定性中的调控机制（Science Advances 2020，Nature Protocols 2021）。
4） 阐明表观遗传调控DNA损伤修复关键因子的新机制及其在肿瘤放化疗增敏中的作用（Science Advances 2019）。
著作论文
代表性论文：
1. Li Z#, Duan S#, Hua X, Xu X, Li Y, Menolfi D, Zhou H, Lu C, Zha S, Goff S, Zhang Z*. Asymmetric distribution of parental H3K9me3 in S phase silences L1 elements. Nature. 2023. 623 (7987), 643-651. https://www.nature.com/articles/s41586-023-06711-3
2. Li Z, Zhang Z*. A tale of two strands: decoding chromatin replication through strand-specific sequencing. Molecular Cell. 2025. 85 (2): 238-261. https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(24)00875-X
3. Li Z, Zhang Z*. Histone chaperones: A multinodal highway network inside the cell. Molecular Cell. 2023. 83 (7), 1024-1026. https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(23)00161-2
4. Du W#, Shi G#, Shan CM#, Li Z#, Zhu B*, Jia S*, Li Q*, Zhang Z*. Mechanisms of chromatin-based epigenetic inheritance. Science China-life Sciences, 2022. 65(11): 2162-2190. https://link.springer.com/article/10.1007/s11427-022-2120-1
5. Li Z#, Hua X#, Serra-Cardona A, Xu X, Zhang Z*. Efficient and strand-specific profiling of replicating chromatin with eSPAN in mammalian cells. Nature Protocols. 2021. 16 (5), 2698-2721. https://www.nature.com/articles/s41596-021-00520-6
6. Li Z#, Hua X#, Serra-Cardona A#, Xu X#, Gan S, Zhou H, Yang WS, Chen CL, Xu RM, Zhang Z*. DNA polymerase α interacts with H3-H4 and facilitates the transfer of parental histones to lagging strands. Science Advances. 2020. 6 (35), eabb5820. https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abb5820
7. Tang M#, Li Z#, Zhang C, Lu X, Tu B, Cao Z, Li Y, Chen Y, Jiang L, Wang H, Wang L, Wang J, Liu B, Xu X, Wang H, Zhu WG*. SIRT7-mediated ATM deacetylation is essential for its deactivation and DNA damage repair. Science Advances. 2019. 5 (3), eaav1118. https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.aav1118
8. Li Z#, Li Y#, Tang M, Peng B, Lu X, Yang Q, Zhu Q, Hou T, Li M, Liu C, Wang L, Xu X, Zhao Y, Wang H, Yang Y, Zhu WG*. Destabilization of linker histone H1.2 is essential for ATM activation and DNA damage repair. Cell Research. 2018. 28 (7), 756-770. https://www.nature.com/articles/s41422-018-0048-0
9. Li Y#, Li Z#, Dong L, Tang M, Zhang P, Zhang C, Cao Z, Zhu Q, Chen Y, Wang H, Wang T, Lv D, Wang L, Zhao Y, Yang Y, Wang H, Zhang H, Roeder RG, Zhu WG*. Histone H1 acetylation at lysine 85 regulates chromatin condensation and genome stability upon DNA damage. Nucleic Acids Research. 2018. 46 (15), 7716-7730. https://academic.oup.com/nar/article/46/15/7716/5047268
10. Li Y#, Li Z#, Zhu WG*. Molecular mechanisms of epigenetic regulators as activatable targets in cancer theranostics. Current Medicinal Chemistry. 2019. 26(8), 1328-1350. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28933282/
学术兼职
BMC Genomics等学术期刊编委。